L’objectif est de se familiariser avec les étapes d’analyses des données transcriptomiques ou RNA-seq avec référence pour extraire les gènes et fonctions différentiellement exprimés. Nous proposons au personnel non-bioinformaticien de les accompagner dans la prise en main de ces étapes d’analyses en utilisant la plateforme de bio-analyse Galaxy.

Après une introduction à la transcriptomique, une session pratique sur la plateforme Galaxy couvrira comment :
- évaluer la qualité des données transcriptomiques,
- aligner des données transcriptomiques sur un génome de référence,
- estimer le nombre de séquences par gènes,
- construire et faire une analyse d’expression différentielle des gènes
- faire une analyse de l’enrichissement fonctionnel des gènes différentiellement exprimés